隐匿性生殖器畸形出生后小儿生殖器明显短小，但属于假性短小，生殖器官缩藏于体内，用手将下体皮肤向内挤压才会显露出来。不及时治疗，会影响生殖器正常发育和正常排尿、成年后夫妻生活及孩子心理健康。

生殖器官畸形尿道及开口正常，但生殖器官的长度小于1厘米，进入青春期后生殖器官长度小于5厘米，直径亦较小。第二性征发育多较差，生殖器官多存在勃起障碍，严重者有排尿困难。常伴有双侧隐睾、睾丸发育不良、垂体功能减退及肥胖等。不及时矫治，会影响成年后夫妻生活、生育问题。

包茎及包皮过长包茎指包皮口过小，包皮不能上翻显露出生殖器龟头；包皮过长指包皮覆盖全部生殖器，而包皮口并不小，可以上翻显露出生殖器龟头。新生儿的包皮粘连是一种正常的生理现象，一般到2～3岁可自然消失。包茎及包皮过长会引起包皮炎、包皮结石、生殖器官白斑及生殖器官癌等疾病。如果引起包皮嵌顿，严重时会引起龟头坏死，还可能造成生殖器发育不良，影响成年后夫妻生活。

尿道下裂小儿尿道发育不全，尿道外口位置异常，常蹲着尿尿。学龄前不治疗，会造成排尿困难，以及精神上与生活上的痛苦。

隐睾孩子出生后两个状如花生米大小的睾丸没有在阴囊内，用手触摸不到。不及时治疗会影响患儿将来生育能力，睾丸还可能发生恶变、坏死。

小儿腹股沟疝气小儿常不明原因的哭闹，腹部出现包块，以及剧烈的呕吐、发烧、便血等症状。不及时治疗会影响患儿消化系统，出现下腹部坠胀、腹胀气、腹痛、便秘、吸收功能差、易疲劳和体质下降等症状。还可因疝气的挤压而影响生殖系统的正常发育等。

生殖器官过早发育12岁以前生殖器官长度（生殖器官根部到尿道外口处的距离）已达四五厘米或以上，由此带来的心理困扰和冲动，很容易引起行为异常。由内分泌疾病引发的过早发育可造成更大危害。

鞘膜积液孩子一侧腹股沟或阴囊肿块，或两侧的局部肿块，生长较慢，不引起疼痛。当肿块较大时，可有坠胀感。平卧后，可见肿块缩小。不及时治疗会影响孩子睾丸的发育和成年后精子形成。