Hp感染复发是指Hp阳性的患者经正规治疗，Hp根除成功一段时间后，在1个月内未服用抗生素、半个月内未服用抑酸剂及抗酸剂的情况下，再次行Hp检测的结果为阳性。复发一般包括两种不同的机制：再燃和再感染。

1.1再燃

再燃是指Hp根除成功后，Hp原始菌株再出现。根除治疗并未彻底清除Hp，根除药物的持续作用使菌株总量及活性暂时降低，菌株分布发生变化或隐藏在不易被检测的部位，导致在治疗后的短时间内检测Hp的结果为阴性。随着停药时间的延长，药物持续作用变弱甚至消失，菌株活性逐渐恢复并大量繁殖，此时检测Hp，结果复变阳性。

1.2再感染

再感染是指经根除治疗，Hp原始菌株被彻底清除，一段时间后，宿主重新感染Hp新菌株(与原始菌株不同)，检测结果再次为阳性。再感染可能与多种因素有关。

1.3Hp感染复发的临床诊断

再燃和再感染的鉴别可有助于指导临床采取相应的治疗和随访措施，对于医疗实践有重大意义。目前Hp感染复发的临床诊断取决于复发的时间、胃黏膜组织学和细菌学等。若不鉴定Hp菌株，便很难区分再燃和再感染。在临床实践中，普遍认为，Hp根除成功后第一年内的复发多是再燃，一年或多年以后复发，则多为再感染。目前应用DNA指纹图谱技术，比较治疗前和复发后Hp的DNA指纹图谱，两次图谱相同则考虑为再燃，不同则考虑为再感染。Raymond等应用分子工具分析两个管家基因(hspA和glmM)的多态性来确定每个分离菌株的基因型来区分再燃和再感染。

目前只有少数研究应用DNA指纹图谱技术或分子工具区分再燃和再感染。有研究表明，新菌株的再感染主要发生在Hp感染率高的发展中国家。