目前，对胃息肉的病因及发病机制仍不完全清楚，初步研究提示：

1.增生性息肉或炎性息肉通常是由于胃内感染和损伤引起的适应性反应，如幽门螺杆菌(H.p)感染，在中国感染率达57%～75%，H.p阳性的增生性息肉患者在成功根除H.p感染后，其中约40%的患者息肉完全消退；

2.而腺瘤性息肉和H.p感染关系不明确，它的发生多与基因突变有关，可能是由于外界或环境因素改变而导致多个基因改变造成的。

3.家族性息肉有家族史或遗传可能。

4.药物疾病原因：某些药物长期刺激胃粘膜而发生息肉；也有报道称质子泵抑制剂长期服用也会刺激产生；此外，胃食管返流症等疾病也会引起息肉发生。