一些癫痫及癫痫综合征都具有遗传特征。我们到底遗传了什么导致癫痫的发生？异常的基因表达会导致大脑发育上出现不同程度损伤。

皮质发育畸形（MCD）

大脑皮质发育畸形（MCD）是发展性疾病的主要原因，包括癫痫或生理缺陷。而导致MCD的异常基因主要参与细胞增殖和分化，神经元迁移或大脑皮层组织发育。无脑回、巨脑回或皮层组织严重异位都是由于神经元的异常迁移引起严重的神经损伤。

研究表明LIS1、DCX、ARX、RELN、VLDLR 、ACTB、ACTG1、TUBG1、KIF5C、KIF2A和CDK5基因异常与这些畸形相关。MCD中例如皮质异位与DCX，FLN1A 和ARFGEF2基因的异常表达相关，同时引起神经和认知不同程度损害。巨脑、多发性硬化症或局灶性皮层发育不良与PI3K-AKT-mTOR通路的基因突变相关。

与MCD相关的癫痫临床表型是十分复杂的。了解皮质畸形的遗传和分子基础可以帮助我们快速的发现新的致病基因，同时在另一些研究中提供证据--不同的皮质畸形可能是不同发育阶段所出现的异常。

离子通道意大利的一项研究表明癫痫患者的编码钠及钾通道的基因中大约50％会产生突变。 SCN2A是最常见的突变基因，其次是SCN1A，KCNQ2，STXBP1，SCN8A，CDKL5和MECP2。除此之外，23个额外的基因中也发现了突变，而且发现其中大多数与癫痫密切相关。神经网络层面

从神经网络层面来说，兴奋-抑制失衡是发作性疾病和神经性精神病的常见病理基础，包括癫痫，精神分裂症和孤独症，它会导致皮层电生理性质的改变。

现今一个基因一种疾病的假说已被证实对于大多数综合征是不正确的。因此临床医生不能只单纯诊断某一种基因表型，而应该考虑到不同基因突变相关表型可能重叠，或可能由同一基因中的突变引起的一系列表型谱。基因表型相关性加大了通过分析基因型来治疗癫痫的难度，临床医生很难选择患者最根本的引发癫痫的基础候选基因。

当癫痫综合征表型分类不明确时，基因应该在更广泛和更全面的基因组中进行筛查。非典型癫痫综合征表型的分子诊断可以拓宽表型-基因型相关性研究。

在遗传学的研究中关于下一代基因测序有了新进展。特别是针对皮层发育的关键基因进行大规模并行测序面板的研究，希望可以通过一种快速和具有成本效益的遗传工具诊断这些畸形。在同一实验中进行多基因筛选帮助我们更多认识到新基因型-表型相关性的优势，并可能识别MCD的遗传原因的分子诊断中缺失的内容。然而这中筛选方法取决于在每个实验中筛选的基因数目，所以下一代测序分析可能会提供更多的变体。为了避免基因诊断的片面性，我们需要对于每一位患者的表型进行细致的分析，包括一些潜在的病因。