1、免疫因素

口腔溃疡免疫学病因的研究以细胞免疫为主。患者存在免疫功能的下降和T淋巴细胞亚群失衡。口腔溃疡患者的免疫球蛋白、补体成分可正常。Y球蛋白可不足、外周血中出现循环免疫复合物(CIC)、抗体依赖性杀伤细胞有增加。

2、遗传因素

对口腔溃疡的单基因遗传、多基因遗传、遗传标记物和遗传物质的研究表明，口腔溃疡的发病有遗传倾向。

3、口腔菌群失调

口腔内部的菌群失调造成口腔黏膜细胞水肿变性，继而局限性坏死形成一个或多个，或大或小的溃疡面，下层是一个坏死组织，有大量炎症细胞浸润。

4、其他因素

事实上有关口腔溃疡发病因素的研究范围远远不止上诉5个方面。大量的临床实践和动物实验证实，尚有许多其他因素值得探讨。例如：氧自由基、微循环状态异常等。