1、去除某些加重病情的因素，包括戒烟酒、避免精神紧张，保持心情舒畅，不服或慎服对胃黏膜有刺激的药物，如阿司匹林、消炎痛、去痛片和保泰松等。
2、饮食调养：饮食要清淡，不吃油腻食物，以免刺激胆汁分泌增多，加重反流和病情。应细嚼慢咽，忌暴饮暴食。避免饮酽茶、烈酒、浓咖啡和进食辛辣、过冷、过热和粗糙食物。
3、西药治疗：胃动力药：此类药物能增加胃肠道蠕动，抑制胆汁反流入胃，常用的有：吗丁啉、莫沙必利。胃黏膜保护剂：硫糖铝，能与胃黏膜的黏蛋白络合形成保护膜，以保护胃黏膜免受胆汁损伤；胃膜素，能在胃内形成膜状物覆盖胃黏膜，以减轻反流的胆汁和胃酸对胃黏膜的刺激；思密达，为胃黏膜保护剂，有加强消化道黏膜屏障作用，有利于胃黏膜的再生；生胃酮，能促使胃黏膜分泌黏液，从而保护胃黏膜；吉福士，有保护胃黏膜、促进炎症愈合作用。
4、中药治疗经过对胆汁反流性胃炎治疗的长期的临床实践认为，胆汁反流性胃炎的中医辨证，大多属于脾胃升降失调、水饮停滞胃脘，兼有肝气郁结。按此辨证结果对症下药，效果比较理想。
5、手术治疗手术方法基本有四种。
（1）改成BillrothI术式如原为BillrothⅡ式胃切除者，改成BillrothI式，约半数病人的症状可获改善。
（2）Roux-en-Y手术原为BillrothⅡ式手术者，将吻合口处输入段切断，近侧切端吻合至输出袢。
（3）空肠间置术原为BillrothⅠ式胃切除者，在胃十二指肠吻合口中间置入一段长约20cm的空肠，有效率为75%。
（4）Tanner手术适用于原为BillrothⅡ式手术者，切断空肠输入袢，远侧切端与空肠输出袢吻合成一环状袢，近侧切端吻合至距原胃空肠吻合口50cm的空肠上。
除此以外，为了防止吻合口溃疡的发生，可考虑作迷走神经切断术。